哈佛大學運用Google Cloud超級電腦 研究心臟病新療法

記者/竹二

近日哈佛大學的一項尖端醫療研究計畫獲得Citadel Securities與Google Cloud的贊助,這項研究採用Google Cloud超級電腦運算服務,來模擬心血管疾病新興療法在人體內的成效。

哈佛大學的一項尖端醫療研究計畫獲得Citadel Securities與Google Cloud的贊助。示意圖。(圖/123RF)

磁性控制的人造細菌鞭毛,用數位分身模擬新療法

主導這個計畫的是哈佛大學工程與應用科學學院教授Petros Koumoutsakos,他的主要研究為利用磁性控制的人造細菌鞭毛(Artificial Bacterial Flagella,ABF),用以攻擊與溶解人體血管系統中的血塊及腫瘤細胞,創造數位分身來模擬這項新療法的效果,必須要能夠準確呈現人體內血管的形狀、大小與排列,也要具備逼真的血液流動與結構的相互作用,並能主動控制ABFs。

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不過,Koumoutsakos提到,目前全球只有少數的超級電腦,才能夠提供運作如此複雜規模的模擬所需的運算能力,有了Citadel Securities與Google Cloud的支援,就可以利用公有雲資源來處理大規模且逼真的醫療應用模擬,藉由輕鬆造訪公開的雲端資源來縮短解決時間,提高測試能力,降低處理某些急迫問題的研究成本。

雲端運算有潛力,想變超級電腦還有挑戰

Google Cloud高效能運算技術專家Bill Magro也表示,大眾已經意識到雲端在解決問題與科學工程運算上的潛力,可是要變更雲端運算基礎設施讓它更像超級電腦,還必須要改變軟體與網路,以及硬體設計。

據了解,哈佛團隊在初期測試中,使用Google Cloud的雲端資源已經可以達到專用超級電腦的8成運算效能,相關測試在GPU與CPU上部署2款不同的程式碼,用以進行高效能運算的最佳化,其中之一是入圍2015年超級電腦應用軟體設計獎Gordon Bell Prize決賽的先進程式碼,另一個則是用以執行粒子模擬的開源程式碼LAMMPS。

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